Araştırmacılar, insan transkriptomunun şimdiye kadarki en kapsamlı kataloglarından birini oluşturdu – ScienceDaily

Araştırmacılar, insan transkriptomunun şimdiye kadarki en kapsamlı kataloglarından birini oluşturdu – ScienceDaily
Yazıyı beğendiyseniz lütfen Paylaşın

[ad_1]

Araştırmacılar, tamamlayıcı dizileme tekniklerini akıllıca birleştirerek, bilinen RNA moleküllerinin işlevine ilişkin anlayışımızı derinleştirdi ve binlerce yeni RNA keşfetti. Transkriptomumuzu daha iyi anlamak, hastalık süreçlerini daha iyi anlamak ve terapötik hedefler veya biyobelirteçler olarak hizmet edebilecek yeni genleri ortaya çıkarmak için gereklidir.

‘RNA Atlası, insan kodlamayan RNA’ların kataloğunu genişletiyor’ makalesi, bugün Doğa Biyoteknolojisi, insan transkriptomunun karmaşıklığını daha da çözmek için beş yıldan fazla süren sıkı çalışmanın sonucudur. İnsan hücreleri ve dokularındaki tüm RNA moleküllerini karakterize etmek için daha önce hiç bu kadar kapsamlı bir çaba gösterilmemişti.

Tüm şekil ve boyutlarda RNA’lar

Transkriptomumuz – genomumuza benzer – genomumuzu oluşturan DNA ipliklerinden kopyalanan tüm RNA moleküllerinin toplamıdır. Ancak, ikincisi ile 1’e 1 ilişki yoktur. İlk olarak, her hücre ve doku, dokuya özgü RNA’lar dahil olmak üzere değişen RNA üretimi ve kompozisyonları ile benzersiz bir transkriptomlara sahiptir. İkincisi, tüm RNA’lar, sonunda protein üreten tipik protein kodlama genlerinden kopyalanmaz. RNA moleküllerimizin çoğu, protein oluşturmak için bir şablon olarak kullanılmaz, ancak bir zamanlar önemsiz DNA olarak adlandırılan şeyden kaynaklanır: bilinmeyen işlevlere sahip uzun DNA dizileri.

Bu kodlamayan RNA’lar (ncRNA’lar) her türlü şekil ve boyutta gelir: kısa, uzun ve hatta dairesel RNA’lar. Birçoğu, protein kodlayan RNA’lar için tipik olan adenin moleküllerinin kuyruğundan bile yoksundur.

300 insan hücre ve doku tipi ve üç sıralama yöntemi

“Transkriptomumuzu kataloglamak için başka projeler de oldu, ancak uygulanan sıralama yöntemleri nedeniyle RNA-Atlas projesi benzersiz” diyor prof. Ghent Üniversitesi Tıbbi Genetik Merkezi’nden Pieter Mestdagh. “Sadece 300 kadar insan hücre ve doku tipinin transkriptomuna bakmakla kalmadık, en önemlisi, bunu biri küçük RNA’ları, biri poliadenile (polyA) RNA’ları ve bir teknikle hedefleyen üç tamamlayıcı dizileme teknolojisi ile yaptık. toplam RNA dizilimi denir.”

Bu son dizileme teknolojisi, yeni bir poliadenillenmemiş tek ekson gen sınıfı ve birçok yeni dairesel RNA dahil olmak üzere binlerce yeni kodlamayan RNA geninin keşfedilmesine yol açtı. Araştırmacılar, farklı dizileme yöntemlerinin sonuçlarını birleştirerek ve karşılaştırarak, ölçülen her RNA transkripti için farklı hücre ve dokulardaki bolluğu, bir poliA-kuyruğuna sahip olup olmadığını tanımlayabildiler (görünüşe göre bazı genler için bu, hücre tipinden hücre tipine farklılık gösterir) ve doğrusal olup olmadığı daireseldir. Ayrıca, konsorsiyum bazı ncRNA’ların işlevini belirlemede önemli ipuçları aradı ve buldu. Farklı hücre tiplerindeki farklı RNA’ların bolluğuna bakarak, düzenleyici işlevleri gösteren korelasyonlar buldular ve bu düzenlemenin transkripsiyon seviyesinde mi (protein kodlayan genlerin transkripsiyonunu önleyerek veya uyararak) yoksa transkripsiyon sonrası mı (örn. aşağı RNA’lar).

Biyomedikal bilim için paha biçilmez bir kaynak

Tüm veriler, analizler ve sonuçlar (birkaç bilgi kitaplığına eşdeğer), R2 web portalında indirilebilir ve sorgulanabilir, bu da topluluğun bu kaynağı kodlamayan RNA biyolojisi ve işlevinin araştırılması için bir araç olarak uygulamasını sağlar.

Baylor Tıp Fakültesi’nden Prof. Pavel Sumazin: “Tüm verileri tek bir kapsamlı katalogda birleştirerek, dünya çapında hastalık süreçleri üzerine çalışan biyomedikal bilimciler için yeni ve değerli bir kaynak yarattık. Transkriptomun karmaşıklığının daha iyi anlaşılması gerçekten çok önemli. hastalık süreçlerini daha iyi anlamak ve terapötik hedefler veya biyolojik belirteçler olarak hizmet edebilecek yeni genleri ortaya çıkarmak için RNA terapötiklerinin yaşı hızla yükseliyor – hepimiz RNA aşılarının etkileyici bir şekilde yaratılmasına tanık olduk ve şimdiden RNA’yı hedefleyen ilk ilaçlar kullanılıyor Önümüzdeki yıllarda ve onyıllarda bu terapilerden daha fazlasını göreceğimize eminim.”

Hikaye Kaynağı:

tarafından sağlanan malzemeler Gent Üniversitesi. Not: İçerik, stil ve uzunluk için düzenlenebilir.

.

[ad_2]

Kaynak

admin

admin

Talebemektebi bir sevdanın hikayesi

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir

Translate »